Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms