Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAIQ8N9R8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms