Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR53Q7Z5U6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms