Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q6P435 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q6P435 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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