Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF20Q5VT98 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms