Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms