Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms