Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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