Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms