Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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CDH18Q13634 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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