Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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