Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MRPL28Q13084 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MRPL28Q13084 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MRPL28Q13084 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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