Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRJQ12913 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms