Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms