Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms