Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB3Q05901 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms