Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms