Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL39P62891 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RPL39P62891 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPL39P62891 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms