Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMSP52788 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMSP52788 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMSP52788 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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