Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms