Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms