Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms