Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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