Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOA4P06727 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOA4P06727 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOA4P06727 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOA4P06727 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms