Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HMGB1P1B2RPK0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms