Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGPD3A6NKT7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGPD3A6NKT7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms