Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC6Q9Y625 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC6Q9Y625 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC6Q9Y625 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms