Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.432e-19■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-19■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-19■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-19■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-206ENST00000483559 2392 ntTSL 229.49■■■□□ 2.317e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-202ENST00000428398 718 ntTSL 528.55■■■□□ 2.167e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-204ENST00000459905 2339 ntTSL 227.98■■■□□ 2.077e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-203ENST00000443788 839 ntTSL 227.96■■■□□ 2.077e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.757e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.194e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.167e-10■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.994e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 521.24■□□□□ 0.994e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 FBXW5-208ENST00000491246 785 ntTSL 520.75■□□□□ 0.917e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.767e-10■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 519.04■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 518.24■□□□□ 0.513e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.513e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.494e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 517.96■□□□□ 0.473e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 317.61■□□□□ 0.417e-10■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 517.61■□□□□ 0.417e-10■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.387e-10■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.34e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-218ENST00000473999 1277 ntTSL 315.61■□□□□ 0.097e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 315.1■□□□□ 0.013e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -04e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.017e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-11■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.067e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.177e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 212.52□□□□□ -0.414e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 510.92□□□□□ -0.663e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.874e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.024e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-14■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 37.15□□□□□ -1.264e-7■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.537e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.547e-6■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.782e-14■□□□□ 11.1
UTP18Q9Y5J1 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 321.02■□□□□ 0.965e-9■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.885e-9■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-9■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.765e-9■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.11□□□□□ -0.315e-9■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 520.16■□□□□ 0.827e-8■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 318.94■□□□□ 0.627e-8■□□□□ 11
UTP18Q9Y5J1 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 318.15■□□□□ 0.51e-23■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 25.5□□□□□ -1.531e-23■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.171e-23■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.593e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.083e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 215.29■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 10.9
UTP18Q9Y5J1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.386e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.36e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.084e-14■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.936e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.916e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.846e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 420.18■□□□□ 0.826e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-204ENST00000553810 550 ntTSL 320.04■□□□□ 0.86e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-206ENST00000554013 461 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.676e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 219.02■□□□□ 0.636e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-205ENST00000553819 856 ntTSL 318.42■□□□□ 0.546e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 U2AF2-207ENST00000592867 447 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.266e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 216.24■□□□□ 0.196e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 215.38■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 314.71□□□□□ -0.056e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC14.43□□□□□ -0.16e-6■□□□□ 10.8
UTP18Q9Y5J1 VIL1-202ENST00000392114 1968 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.284e-14■□□□□ 10.8
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