Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF6Q9Y4K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF6Q9Y4K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms