Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMED3Q9Y3Q3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMED3Q9Y3Q3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms