Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRG3Q9Y2Y8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRG3Q9Y2Y8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms