Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERGIC3Q9Y282 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERGIC3Q9Y282 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms