Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDAC5Q9UQL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDAC5Q9UQL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC5Q9UQL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms