Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC8A2Q9UPR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC8A2Q9UPR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms