Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN11Q9UMQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN11Q9UMQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms