Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI4Q9UM07 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI4Q9UM07 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI4Q9UM07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms