Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD4Q9ULV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD4Q9ULV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms