Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF490Q9ULM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF490Q9ULM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF490Q9ULM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms