Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCE2Q9UKZ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms