Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA11Q9UKX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGA11Q9UKX5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA11Q9UKX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms