Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX41Q9UJV9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX41Q9UJV9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX41Q9UJV9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms