Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP3AQ9UFN0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms