Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJB4Q9UDY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms