Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTTNBP2NLQ9P2B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms