Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRNQ9P2B2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms