Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTN3Q9P232 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms