Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms