Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SENP1Q9P0U3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms