Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD2Q9NZR1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD2Q9NZR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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