Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN3Q9NZ94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms