Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC39A1Q9NY26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A1Q9NY26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms